Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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