Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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