Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms