Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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