Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TROQ12816 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TROQ12816 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TROQ12816 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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