Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms