Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms