Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms