Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms