Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms