Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms