Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms