Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms