Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms