Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms