Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4GALNT1Q00973 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4GALNT1Q00973 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms