Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms