Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms