Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms