Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOX8P57073 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOX8P57073 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOX8P57073 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX8P57073 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms