Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms