Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms