Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms