Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC16A1P53985 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms