Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms