Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5CP51148 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5CP51148 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5CP51148 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5CP51148 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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