Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MLH1P40692 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MLH1P40692 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MLH1P40692 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MLH1P40692 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms