Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL1P40616 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL1P40616 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms