Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDRP35968 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDRP35968 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDRP35968 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDRP35968 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KDRP35968 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms