Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP214P35658 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms