Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms