Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PPIFP30405 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms