Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms