Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5AP29375 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms