Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARID4AP29374 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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