Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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