Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCAP28676 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms