Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms