Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms