Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR1P21453 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms