Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms