Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMNB1P20700 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms