Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRHP20396 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRHP20396 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRHP20396 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRHP20396 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRHP20396 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRHP20396 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms