Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAV1P15498 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms