Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms