Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms