Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms