Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHGAP10645 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms