Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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