Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD4P09016 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD4P09016 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD4P09016 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD4P09016 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD4P09016 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms